В марте 1992 года городской отдел народного образования реорганизован в управление образования администрации города Воронежа.
На основании постановления Воронежского горисполкома в 1998 году управление образования администрации города Воронежа вошло в состав департамента социальной политики администрации города Воронежа.
Распоряжением главы города Воронежа в 2000 году управление образования департамента социальной политики администрации города Воронежа реорганизовано в комитет образования администрации города Воронежа.
В 2002 году комитет образования администрации города Воронежа вошел в состав департамента социальной политики администрации города Воронежа.
В 2004 году комитет образования реорганизован в управление образования администрации города Воронежа.
На основании распоряжения главы городского округа город Воронеж в 2005 году управление образования администрации города Воронежа переименовано в управление образования администрации городского округа город Воронеж.

В 2010 году управление образования администрации городского округа город Воронеж переименовано в департамент образования администрации городского округа город Воронеж.

На основании решения Воронежской городской Думы от 29 августа 2012 года «О структуре администрации городского округа город Воронеж» и распоряжения администрации городского округа город Воронеж от 12 октября 2012 года департамент образования администрации городского округа город Воронеж переименован в управление образования администрации городского округа город Воронеж.

Управление образования администрации городского округа является структурным подразделением администрации городского округа город Воронеж, осуществляющим управление в сфере образования.
Управление создается, реорганизуется и ликвидируется решением Воронежской городской Думы.

Управление наделено правами юридического лица, может иметь самостоятельный баланс, лицевые счета в Управлении Федерального казначейства по Воронежской области и управлении финансово-бюджетной политики администрации городского округа город Воронеж, имущество на праве оперативного управления, печать с изображением герба городского округа со своим наименованием, а также соответствующие печати и штампы, бланки и другие документы, необходимые для осуществления своей деятельности.

Финансирование деятельности Управления осуществляется за счет средств бюджета городского округа город Воронеж.

Управление находится в непосредственном подчинении заместителя главы администрации по социальной политике.

Непосредственное руководство деятельностью Управления осуществляет руководитель, назначаемый на должность и освобождаемый от должности распоряжением администрации городского округа город Воронеж.